做好柠檬水一般能放1到2天，放三天可能变味。冷藏保存的话，密封好的容器可以多放半天。如果加蜂蜜或冰块，保质期会缩短。喝之前要闻味道，发酸或有絮状物就不能喝了。

因为柠檬水酸度在pH3左右，能抑制大部分细菌，但无法完全灭菌。糖分和柠檬酸是天然防腐剂，但随时间会分解失效。实验数据显示，常温下柠檬水4小时后细菌数量翻倍，冷藏能延缓到12小时。蜂蜜会消耗水分，导致糖浓度降低，保质期从24小时缩短到18小时。冰块融化会稀释酸度，使pH值升高0.5-1个单位，加速微生物繁殖。所以建议现做现喝，最多冷藏保存不超过24小时，超过这个时间即使没坏也可能口感变差。