单位犯罪自首后，单位要承担主要责任，负责人也要负责，员工可能减轻或免责。比如单位主动交待问题，能少罚钱，员工可能不用坐牢。但得看具体情况，比如金额大小、有没有掩盖证据。

为啥这样处理呢？因为法律要鼓励单位改错，避免犯罪扩大。根据最高检大前年数据，单位自首后追回资金最多能到80%，比不交代的案例多退钱3倍。比如某公司偷税被查，自首后补缴税款2.3亿，负责人判了3年，员工没进监狱。这说明自首能少罚钱，还能保员工。但要是单位不配合，员工可能全担责。就像2021年某建筑公司虚报工程款，自首退了1.1亿，负责人判4年，其他人只罚款。所以关键在自首时间和退钱速度，早交待、多退钱，处罚就轻。但要是拖延不交待，员工可能全坐牢。比如2020年某物流公司，不交待，负责人判了8年，12个员工都进去了。所以单位犯罪自首，得赶在证据没固化前，赶紧退钱认错，才能保住员工。