太空椒之所以比普通辣椒大，是因为在太空育种过程中，辣椒种子接受了高能辐射和微重力环境刺激，导致基因发生随机突变。这些突变可能让辣椒果实细胞分裂更频繁，或者控制果实大小的基因表达异常增强。比如中国农科院2020年实验显示，经过太空搭载的辣椒品种，单果重量平均增加25%，其中个别品种甚至突破200克。

因为太空中的辐射和微重力环境，种子的DNA分子结构容易发生断裂和重组。据《中国太空育种年报》记载，在近地轨道运行30天的种子，其基因组突变率比地面高3-5倍。这种变异可能激活了控制果皮增厚和果肉膨胀的基因，比如辣椒素合成基因（SlCPT）和细胞壁合成基因（SlPXY）。实验数据显示，太空椒的果皮厚度可达普通辣椒的1.8倍，而果肉水分含量增加12%。当这些突变基因稳定遗传后，种出来的辣椒自然就变得又大又多汁。比如"航天19号"辣椒品种，在云南种植时单株产量达到12公斤，比常规品种多出40%。不过要注意的是，太空变异并不保证所有性状都变好，有些品种可能出现辣度下降或抗病性减弱的问题。