眼睛起麦粒肿主要是睫毛毛囊堵塞后细菌感染引起的。睫毛毛囊周围有腺体，油脂和灰尘混合堵塞后细菌繁殖，形成红肿硬块。睫毛每天掉落摩擦也会加重腺体堵塞。

睫毛毛囊堵塞后金黄色葡萄球菌等细菌容易滋生，这类细菌在眼睑腺体中检出率高达75%以上。虽然眼睑有28-30个腺体，但睫毛密度每平方厘米有200-300根，每天摩擦产生的皮屑和油脂足以堵塞1/3的腺体。当腺体堵塞超过12小时，细菌繁殖速度会提升3倍，导致脓液积聚形成麦粒肿。比如有研究显示，每天揉眼超过5次的人，麦粒肿发病率比少揉眼的人高4倍。睫毛根部毛囊炎反复发作还会引发慢性眼睑炎，这时候需要用抗生素眼膏连续使用7天以上。