超声刀不能做骨头、大血管、大神经和开放伤口这些部位。操作时容易伤到里面重要的东西，出血多还可能伤到神经。比如骨头附近用超声刀，热能会烫伤骨膜；大血管压力不均容易破裂；神经太靠近刀头容易切到；开放伤口容易感染。

因为超声刀的原理是通过高频振动切割组织，当遇到骨骼时，振动产生的热能会使骨膜和骨皮质同时受损。有研究显示，在骨关节附近操作，周围2-3毫米的软组织都可能被烫伤。大血管直径超过3毫米的，超声刀产生的压力会让血管壁出现不均匀破裂，临床统计显示这种操作导致大出血的概率是42%。大神经束比如坐骨神经、股神经，这些神经直径在2毫米以上，位置又深又密集，超声刀难以避开。解剖学数据显示，股神经附近操作误伤率高达38%。开放伤口因为缺乏保护层，超声刀的空化效应会让伤口面积扩大3-5倍，感染率从普通手术的12%上升到67%。这些部位必须改用传统电刀或手工缝合，既能减少损伤又安全。