这次疫情主要来源是蝙蝠携带的病毒通过中间宿主传给人。蝙蝠本身没直接感染，但人接触了中间动物才生病。比如穿山甲和水貂都检测到过类似病毒，但还没找到最终中间宿主。

为什么说是自然起源呢？首先蝙蝠是天然病毒库，全球有400多种蝙蝠携带冠状病毒，其中菊头蝠携带的RaTG13病毒和新冠病毒基因相似度有96.2%。中间宿主研究显示，穿山甲体内发现新冠病毒刺突蛋白受体结合域相似片段，而水貂养殖场2021年爆发疫情后，病毒进化出更适应人类的版本。中国疾控中心2020年检测到穿山甲体内有类似新冠病毒的基因片段，但还没完全确定。科学家用基因测序发现，蝙蝠病毒到穿山甲只需3代变异，再到人类可能需要再变异2代，所以中间宿主可能是其他未检测到的动物。比如云南的和穿山甲都有冠状病毒，但还没找到能直接传给人那一步的动物。