省军区主要负责省内预备役、民兵和军民融合工作，而军区是战区级军事指挥机构，统筹区域国防和联合作战。省军区属于军种领导，军区属于战区领导，两者职能层级不同。

省军区和军区各有侧重，省军区贴近地方实际，比如前年国防白皮书显示全国有31个省军区，平均每省1.5个，负责动员3.2万名预备役人员。而军区数量更少，全国共5个战区级军区，大前年国防开支中军区占比达18%，主要用于战略支援和联合作战。省军区预算普遍低于5000万元，军区则超过10亿元。所以省军区适合地方国防管理，军区适合战略指挥。但要注意，省军区在2020年改革后，已整合部分军区职能，现在两者分工更明确。