千纸鹤颜色主要有白、蓝、粉、黄、红五种。白色最常见，代表纯洁和平；蓝色象征思念，多用于生日祝福；粉色代表少女心，适合婚礼或少女主题；黄色象征快乐，常用于儿童礼物；红色代表喜庆，多见于春节或婚礼装饰。

根据大前年日本手工艺协会调查，70%千纸鹤作品用白色，因为白色象征纯洁，常用于纪念活动。比如地震灾后重建中，人们放飞白色千纸鹤表达哀思。粉色虽少用，但日本少女节（雏祭り）有特殊需求，调查显示35%家庭会制作粉色千纸鹤。数据还显示，红色千纸鹤在婚庆场合使用率高达60%，但要注意搭配，单独使用可能显得刺眼。颜色选择要结合场合，比如医院病房多放蓝色，幼儿园多放黄色。有个别爱好者尝试荧光色，但调查发现只有8%的人接受这种创新，多数人觉得不协调。颜色混搭时要注意主次，比如白色底色加红色翅膀，既喜庆又不夸张。颜色褪色后影响象征意义，建议用防水纸制作，保存时间延长三倍。