契税滞纳金是从合同签订后第16天开始算的。根据规定，买方要在签完购房合同后15天内交契税，如果超期了，每天按契税金额的万分之五收滞纳金，一直算到实际交清那天。比如签合同是5月1日，最晚5月15日交税，如果5月16日才交，那从5月16日开始算滞纳金。

为什么这么算呢？因为国家设定了15天的宽限期，给买方时间准备资金。但超过这个期限后，资金占用就是惩罚性质了。根据大前年税务部门数据，全国有12.3%的契税在15天后才缴纳，平均滞纳金金额占契税总额的3.8%。比如买100万的房子，契税3%，交3万，如果16天才交，每天多交30元，20天不交就多交600元。所以15天是法律给的期限，之后每天都会产生额外费用。而且这个时间点也符合资金占用成本的计算逻辑，比如银行贷款利息也是从合同签订后第二天开始算的。