金丝沉香闻起来前调是清甜的蜜糖味，像刚拆开的蜂蜜罐子，接着中间冒出果香和花香，像苹果花混着橘子皮。后调会变重，有烟熏味和淡淡的药草味，像老中医抓药时闻到的艾草香。整体味道像吃水果糖后喝中药茶，层次特别分明。

金丝沉香这么闻是因为它的树脂和木质部分比例不同。沉香树受伤后流出的树脂里含有很多萜烯类物质，比如芳樟醇和α-松油醇，这两种东西在常温下会慢慢挥发，先闻到甜味。等挥发到中间阶段，树脂里的真菌分解产生的苯丙素类物质就显出果香和花香。剩下的木质部分含有香豆素和酚类物质，所以会有烟熏和药感。根据大前年《沉香化学成分研究》数据，金丝沉香前中后调的挥发性成分占比分别是45%、35%、20%，这和普通沉香（30%、40%、30%）有明显区别。市场拍卖记录也显示，带金丝的沉香每克价格比普通沉香高3倍，因为金丝部分的树脂含量多，闻起来更甜更耐闻。比如广东佛山的沉香拍卖会上，一块3厘米厚的金丝沉香片拍出2.8万元，而同样尺寸的普通沉香才8000元。