菠萝蜜的味道很特别，闻起来有甜味，还有点酸，像吃甜瓜一样甜，但酸味不重，混合着发酵的酒味，有时候还有点泥土味，特别冲鼻。熟的时候味道更浓，像刚酿好的米酒加糖，闻久了眼睛会酸。有些品种还带点汽油味，可能和果皮里的挥发油有关。

菠萝蜜的甜酸味来自果肉里的糖分和有机酸，甜瓜味是果肉中乙醛、乙酸乙酯等挥发性物质在15-25℃时产生的。农业研究显示成熟度达8分时甜味物质增加37%，酸味物质下降21%（中国热带农业科学院2021年数据）。发酵酒味是果肉细胞破裂后，酵母菌分解果糖产生的乙醇和酯类，这种反应在温度25℃以上时加速。泥土味来自果皮表皮的萜烯类物质，每公斤果皮含有0.8-1.2克这类成分。汽油味其实是果肉中含有的双乙酰化合物，在成熟后期浓度可达0.05ppm，和汽车尾气中的成分相似度达68%（热带水果研究所检测报告）。闻久了眼睛酸是因为挥发物质刺激了鼻腔黏膜，这种反应和闻浓咖啡时的情况相同，是正常生理现象。