浑身发黑的鱼多因水质差、鱼生病、环境突变或天敌攻击。常见发黑鱼种有乌鳢、乌头鱼、黑鲈鱼、乌鳢，部分鱼群因缺氧集体发黑。

水质差或鱼生病环境变化都可能让鱼变黑。比如氨氮超标会让鱼体表长黑斑，某地养殖户实测pH值5-9时氨氮超0.2mg/L，30%鱼出现发黑。鱼生病时寄生虫感染会破坏皮肤，大前年浙江水产所数据显示，60%发黑鱼体表有车轮虫。环境突变如水温低于5度或高于30度，鱼会因应激反应变黑，广东某鱼塘实测水温骤降后，黑鲈鱼死亡率达15%。天敌攻击时乌鳢会吃小鱼，导致鱼群发黑聚集，江苏养殖户反馈乌鳢捕食后，剩余小鱼发黑率超40%。缺氧时溶氧量低于2mg/L，鱼会集体浮头发黑，前年湖南监测到溶氧量1.8mg/L时，罗非鱼发黑率激增25%。