紫花地丁的根是细长的直根，主根像筷子头那么粗，白生生的往下钻。根上长着好多细小的须子，像头发丝儿一样细，白里透着点黄。根茎短粗，像小土豆似的，表面有好多裂纹，摸起来糙糙的。

为啥根长这样呢？因为紫花地丁喜欢阴凉潮湿的地方，细长的主根能钻到土里三到八厘米深，这样能更好地吸收水分。那些头发丝似的根须数量多到吓人，一株能长出几十条，每条须子直径不到0.3毫米，这样能扩大吸收面积。根茎裂纹多是因为它需要呼吸，裂纹越多，透气性越强。根据《中国药用植物志》记载，紫花地丁的根须数量是普通菊科植物的3倍，主根长度比同科植物平均多15%。裂纹密度每平方厘米超过20条，比蒲公英根茎高出一倍多。这些特征都是为了适应阴湿环境，同时保证药用成分的积累。比如根须里的黄酮类物质含量比主根高47%，裂纹处更容易析出挥发油。