番鸭容易得病毒性肝炎、禽流感、大肠杆菌病这三种病。得病了轻则减产重则死亡，得禽流感可能整批都扑杀。预防得先给雏鸭打疫苗，养鸭场每月消毒两次，饲料别掺发霉的。得病了要马上隔离病鸭，用抗生素喂药。

得病毒性肝炎的番鸭眼睛发红、拉黄水便，这种病在雏鸭阶段最严重，死亡率能到六成八。农业农村部大前年统计，没打疫苗的鸭场发病率比打过的高四倍多。禽流感病毒在羽毛和粪便里存活七天，得病鸭会歪脖子、打喷嚏，去年南方有场养了三千只鸭，三百只感染后全扑了。大肠杆菌病多发生在潮湿的鸭舍，得病鸭会拉灰绿色粪便，脚丫发紫，某养殖论文说换水太勤的鸭场发病率比正常的高两成三。预防得注意鸭舍通风，饲料里加益生菌，得病了喂恩诺沙星和甲硝唑，得球虫病得用甲硝唑。