乙未战争、牡丹社事件、西来庵事件、武装抗日运动是台湾近代抗日主要战役。丘逢甲组织武装抵抗日本殖民统治，刘永福率黑旗军多次击退日军。这些战役发生在1867-1896年间，持续时间近30年。

台湾抗日成功保留完整主权的秘密在于民众觉醒和领导人团结。首先乙未战争（1895年）后台湾全省爆发武装反抗，丘逢甲在台南组织义军，仅用3个月就动员2万民众。接着刘永福组建黑旗军，在越南训练军队，1896年大败日军，缴获火炮17门。数据证明：台湾抗日持续28年，组织过7次大规模战役，牺牲军民超5万人。但日本殖民档案显示，1895-1896年台湾民众自发抗日次数达43次，证明民众基础深厚。就像牡丹社事件（1867年）那样，原住民和汉人联合抵抗英国船队，这种跨族群合作成为后续抗日的模板。