西咸新区现在有西北大学、陕西师范大学、西咸学院等十所大学和学院。这些学校分布在沣东新城、沣西新城和秦都片区，既有老牌本科院校，也有新成立的职业院校。比如西北大学和陕西师范大学是重点本科，西咸学院、陕西理工大学是普通本科，还有西安航空学院、杨凌职院等专科院校。

因为西咸新区是2014年成立的国家级新区，专门规划了教育用地。根据《西咸新区总体发展规划》，这里要打造"产教融合示范区"，所以新建了西咸学院（2015年成立）、陕西理工大学（2018年更名）等高校。现有高校数量是西安主城区的1/3，但学生规模达到12万人，比新区成立前多了4倍。沣东新城集中了6所本科院校，沣西新城有4所职业院校，秦都片区主要是西安石油大学和西京学院。这些学校都是教育部"双一流"建设配套项目，比如西北大学在新区设了文理学院，陕西师范大学设了国际联合学院。