太白山的水主要流渭河石头河等河流，部分渗入地下变成饮用水，还有一部分蓄在碧水湖玉皇池这些水库里。每年山上的雨水和融雪加起来有二十多亿立方米，这些水顺着山沟往下淌，都进了黄河水系。

为啥水流成这样呢？首先太白山年降水量650毫米，比平原高两倍多，雨水刚下完就顺着沟壑流走。山腰以下有200多个自然形成的沟谷，每条沟平均长8公里，最长的石头河沟有32公里。这些沟连着县道乡道，水流到公路边就被收集进人工河道。比如去年监测数据显示，经石头河调水到渭河的量是1.2亿立方米，占河道总量的37%。地下渗水主要发生在海拔1800米以下的山体，这里岩石裂隙多，每平方公里能出地下水3000吨。水库方面，碧水湖库容1.2亿立方米，玉皇池0.8亿立方米，正好能存下太白山夏季的暴雨水量。要是雨水太多，山脚的泄洪渠还会自动开闸，去年就泄洪了0.5亿立方米，不然山洪能冲垮3个村庄。