5000元工资不用交税，超过部分按3%起征。6000元工资扣完5000元后，1000元按3%交30元，净拿5900元。

因为个税起征点是5000元，所以5000元刚好不交税。超过部分比如6000元，先扣5000元起征点，剩下1000元按3%税率，算出30元。像社保公积金这些固定扣除，如果有的话，还要再减掉。比如有人月入8000元，扣5000元起征点，再减掉社保1000元，剩下3000元按10%税率，交300元税，净拿7700元。所以工资越高，超过起征点越多，税率越高，但都是分段计税的。结果就是工资减起征点和扣除，剩下的按税率表算税。