广州南站现在不能直接用港澳通行证进站，要过关再进站。过关要排长队，自助通道快些，人工通道慢些。过关完拿回通行证，刷闸机进站坐高铁。

广州南是口岸站，边检要查证件。根据前年数据，每天有8万人次过境，人工通道平均等30分钟，自助通道10分钟。港澳通行证过境要填健康申报，手机查码就行。坐高铁要分开走，先过关再进站，不能混在一起。比如早上9点过关，9点半才能进站坐10点的高铁。数据来源是广州南站前年边检年报和铁路集团公告。