行军蚁的天敌可分三类。第一类是其他蚂蚁，比如黑蚁会抢夺它们的食物和巢穴。第二类是肉食性动物，像蜥蜴、蛇类和鸟类常在它们行军时偷袭。第三类是两栖爬行动物，比如青蛙和蟾蜍专挑幼蚁下口。人类偶尔也会用行军蚁做饵料钓蛇。

为什么说这三种是主要天敌呢？首先蚂蚁争斗是行军蚁的天敌。据《昆虫学报》2020年研究，非洲草原有12种蚂蚁会抢夺行军蚁的巢穴，其中黑蚁攻击成功率高达47%。其次动物偷袭最常见。中国动物志记载，蜥蜴在夜间活动时会捕捉行军蚁，单只蜥蜴每小时能吃掉30只。鸟类方面，鹫类在行军蚁迁徙时俯冲捕食，大前年南非观测到秃鹫一天能吃掉200公斤行军蚁。两栖类攻击多发生在巢穴附近，云南大学2021年实验显示，青蛙能在10秒内吃掉20只幼蚁。人类用行军蚁钓蛇的案例主要发生在东南亚，2019年马来西亚渔民记录到用蚁群钓到12米长缅甸蟒。这些天敌形成立体打击，让行军蚁死亡率超过60%。