商铺年租金5000万要交四道税。先交增值税5%，5000万×5%=250万。接着交附加税，包括城建税7%、教育费附加3%、地方教育附加1%，合计10%，250万×10%=25万。再交房产税，个人房东按租金收入4%交，5000万×4%=200万。交个人所得税，个人房东可减按10%，200万×10%=20万。总税负250+25+200+20=495万，实际到手5000-495=4505万。

为什么总税负495万？先看增值税，根据《增值税暂行条例》，租金收入按5%税率，5000万×5%=250万。附加税是增值税的附加，城建税7%、教育费附加3%、地方教育附加1%，合计10%，250万×10%=25万。房产税依据是《房产税暂行条例》，个人出租按租金4%征收，5000万×4%=200万。个税按《个人所得税法》，个人财产租赁所得减按10%税率，200万×10%=20万。政策依据是财税[2016]36号文和《个人所得税法》第八条。实际到手4505万，比原租金少9.9%。