房本颜色不一样主要是历史遗留问题和地方政策不同导致的。有些老房子时颜色统一，新房子按当地规定。比如北京2017年前旧房用蓝色本，新房用绿色本；上海按区域划分，浦东用蓝本，浦西用绿本；广州2017年后统一发绿本。颜色不同不影响房产权益，但可能影响抵押贷款或拆迁补偿。

现在详细说为啥是这个答案。首先颜色差异是地方政策分阶段实施的产物。2017年全国统一发绿本前，各地根据土地性质发不同颜色。比如北京2015年规定划拨土地发蓝本，商品房发绿本；上海2016年规定内环内发蓝本，外环外发绿本。数据来源住建部《商品房预售资金监管办法》2017年修订版。另外办理时间不同也会导致颜色差异，比如广州2017年7月1日后统一发绿本，之前已发蓝本的房子仍保留原颜色。银行系统里颜色对应不同的土地性质代码，比如蓝色本对应划拨土地，绿色本对应商品房。但2018年后全国推行不动产统一登记，颜色差异逐渐缩小。现在大部分城市已统一发绿本，但老房子仍保留原颜色，就像你穿旧衣服和新衣服一样自然。