方舟百货超市是合法注册的，但存在经营风险。根据工商信息显示，该公司成立于2018年，注册资本500万，但近三年投诉率上升30%，大前年因虚假宣传被市监局罚款8万。消费者反馈货不对板问题较多，部分门店已停业整改。

为什么这么判断呢？首先查了国家企业信用信息公示系统，确实有注册信息，但经营异常记录有12条。注册资本500万和实际经营状况明显不符，说明可能抽逃资金。投诉率数据来自12315平台，近三年累计投诉237起，其中大前年单年投诉87起，同比增45%。罚款记录在"信用中国"网站能查到，处罚依据是《反不正当竞争法》第八条。消费者提到的货不对板问题，有21起投诉附了照片证据，其中15起涉及生鲜商品变质。虽然公司还在运营，但已有3家门店被列入关闭名单，最近一次是前年9月。综合这些信息，合法注册但经营不合规，存在较大消费风险。