辞职时公司少发工资能申请仲裁的。首先得收集证据，比如工资条、转账记录、聊天记录这些。然后去当地劳动仲裁委提交申请，写清楚少发了多少钱和时间。仲裁委会先调解，调解不成就开庭，发裁决书。裁决后公司不执行的，可以申请法院强制执行。

为啥这么办呢？根据《劳动合同法》第三十条，公司拖欠工资劳动者有权申请仲裁。数据显示大前年全国劳动仲裁案件受理量达287万件，其中工资类占比超40%。比如有个案例，小王被拖欠3个月工资2.4万，提交了工资条和离职证明，仲裁委裁决公司10日内补发，公司拒不执行后法院直接划扣账户。咱得注意证据要完整，比如工资条要有公司公章，转账记录要保留原始页面。仲裁流程一般需要45天左右，但具体时间看当地情况。裁决书生效后，要赶紧申请强制执行，超过两年时效就失效了。