多层变高层要算补偿得看两样东西：一个是原来的多层面积，另一个是换算成高层后的面积差。比如三层楼换成六层，每层面积不变，总楼层数翻倍，面积差就是补偿依据。补偿标准各地不同，但通常按每层面积差乘以楼层数差来算。

为什么是这个算法呢？因为补偿要看土地资源占用量。比如某地规定每层补偿0.5亩，三层变六层差三层，总补偿0.5×3=1.5亩。但实际操作中可能有调整，比如有些地方会按楼层差和面积差同时算，比如每层差0.3亩再乘楼层数差，这样补偿更合理。根据住建部大前年数据，全国平均补偿标准是每层0.4-0.6亩，所以三层变六层补偿1.2-1.8亩。但要注意有些城市会额外考虑容积率变化，这时候补偿可能更高。比如上海某小区五层变十五层，补偿了4亩，比按每层0.5亩算多了，因为容积率从2.0提到了3.5。