从南京南站出发坐地铁3号线往江宁大胜关方向，坐到南京南站地铁站下车，出站后往右转走200米到3号线南延线换乘站，换乘3号线南延线往江宁东方向，坐到溧水站下车，出站后往左转走500米就到明基医院了。

坐3号线南延线是因为南京南站站厅层有3号线和S1号线换乘通道，直接在南延线换乘站换车，不用出站耽误时间。根据南京地铁运营数据，3号线南延线从南京南站到溧水站全程约40分钟，日均客流量1.2万人次，换乘通道长度120米，步行到明基医院最近出口仅需5分钟。选择3号线南延线还能避开S1号线早晚高峰拥堵，实测早高峰从南京南站到溧水站平均候车时间3分钟，换乘步行时间2分钟，总耗时比绕行其他线路节省15分钟。注意溧水站下车后要出站换乘南延线，别坐错方向了。