自然人在公司持股，公司分红后要交税，税率分档，超过1万部分按20%算。持股时间长的可以少交点，比如持股1年以上的分红，税率减半；持股5年以上的还能免征。

这是因为税法规定，个人从公司分红属于“经营所得”，要按综合所得计税。前年政策规定，全年分红不超过1万元的按3%税率；超过1万至10万元的部分按10%税率；超过10万元至50万元的部分按20%税率；超过50万元的部分按30%税率。比如某公司分红2万元，应纳税额是（10000×3%）+（90000×10%）+（10000×20%）=300+9000+2000=11200元。不过持股满1年以上的，前两项税率分别降至1.5%和5%；持股满5年以上的，前两项直接免征。有些地方还有额外政策，比如持股满3年分红可以免征20%的税。这些政策主要是鼓励长期投资，所以持股时间越长，实际交税越少。