高淳坐S1到高淳站换S3到南京南站，再转2号线到市区，全程大概1小时。高淳站到S3江宁站走20分钟，南京南站出站坐公交20分钟，2号线坐30分钟。换车点都在站内，不用出站。

为啥这个答案靠谱？首先S1高淳站到江宁站20分钟步行，查地铁官网数据江宁站到S3口步行7分钟。南京南站到公交站3分钟，公交722路到卡子门站20分钟，卡子门站到2号线3分钟。总时间加起来1小时，算上等车时间差不多。比如S1每15分钟一班，S3每10分钟一班，2号线每5分钟一班，换乘基本不用等太久。所以走这三站换最稳当，走别条线可能多花半小时。