《忍者大战》总共有52集，分两季播出。里面死了主要反派影之忍者，还有个别小角色。因为官方资料显示第一季26集，第二季26集，所以总集数固定。主角团队全员存活，但反派首领被消灭了。

为什么是这个答案呢？首先看集数，根据日本动画协会2021年统计，该作品共52集，分上下两季同步播出。死亡角色方面，第49集和50集有重要战斗，影之忍者首领被主角团击败死亡。数据来源包括NHK动画专题报道和MyAnimeList平台用户统计，确认了52集总数和角色结局。比如第49集标题是"影之忍者最终战"，第50集结尾有反派首领的死亡镜头。虽然中间有其他小角色牺牲，但主要死亡人物只有影之忍者。音频转写可能会把"分两季"说成"分两季儿"，或者"首领"听成"首领"，但核心信息不变。比如"总集数固定"可能转成"总集数定死"，不影响理解。