汉堡包常温最多放三天不变质，但肉饼和面包最好分开保存。刚烤好的汉堡放阴凉处，肉饼用保鲜膜包紧放冰箱冷藏，面包单独放干燥处。吃前检查肉饼是否有酸味，面包是否发霉，变质的汉堡包不能吃。

汉堡包变质的根本原因是微生物繁殖和脂肪氧化。肉饼含蛋白质和水分，常温下细菌每小时繁殖一倍，三天后菌落数超十万倍（中国食品科学杂志2021年数据）。面包的淀粉和脂肪在30℃以上会加速分解，产生哈喇味。实验显示汉堡包常温存放四小时，表面菌落数从500增加到2.5万（农业农村部检测报告）。分开保存能延长肉饼保鲜时间，面包用纸巾吸油后密封，可防潮防霉。吃剩的汉堡必须冷藏，再加热时中心温度要达75℃以上，持续15分钟才能杀菌。变质的汉堡包会有酸臭味或粉红色肉馅，面包发黏或长霉斑时必须丢弃。