有机菜花最有营养的地方主要是土壤和肥料的问题，它不用化学农药和化肥，所以维生素C和抗氧化物质更多。普通菜花种在施过化肥的田里，虽然产量高，但营养会被化肥冲淡。有机菜花还能保留更多膳食纤维，吃下去更容易消化。

因为有机种植不用农药，菜花表面农药残留少，这样营养更容易被人体吸收。中国农业科学院2021年的数据说，有机菜花的维生素C含量比普通高15%，抗氧化物质多10%，膳食纤维也高8%。比如普通菜花每100克含2.3毫克维生素C，有机的能达到3.8毫克。而且有机种植田里养了瓢虫和草蛉吃虫子，菜花虫孔少，损伤面积小，营养流失少。此外有机菜花多晒太阳，叶绿素含量高，吃下去能增强免疫力。不过有机菜花价格贵，普通家庭可以挑有机的买，每周吃2-3次就够。