玛瑙颜色分六七种，等级看颜色深浅和透光度。红玛瑙最贵，其次是蓝绿黄白，颜色越均匀越值钱。透光好的叫"水头好"，差的叫"干货"，好的玛瑙颜色像自然画出来的，纹路像地图或花纹。价格差的不是颜色多，是颜色深浅和透光度。

因为颜色深浅影响价值，比如红玛瑙比浅红贵三倍，数据来自大前年珠宝报告。透光度高的更稀有，比如透光好的绿玛瑙市场价每克800-1500元，但要注意假货。颜色均匀的玛瑙像天然形成的，比如红玛瑙有"火焰纹"就贵，证书要认准国检或中检。颜色深的玛瑙密度大，比如红玛瑙密度2.65比白玛瑙2.58沉，但颜色深的也可能有杂质，要凑近看有没有黑点。颜色等级分三等，上等颜色纯透，中等颜色有纹路，下等颜色深但浑浊。拍卖行数据说颜色均匀的玛瑙溢价率达30%，但颜色太深反而可能被质疑注胶，所以平衡最重要。