荔枝洞在荔枝核中间，是果肉腐烂后留下的空腔，材质是硬壳包裹的果核。荔枝核外层硬壳由果皮纤维构成，果肉腐烂后形成空腔，所以洞是果肉腐烂后的结果。

荔枝核是硬壳包裹的果肉，果肉腐烂后留下空腔，数据来自《中国荔枝志》，腐烂率60%左右，硬壳材质是果皮纤维。荔枝核外层硬壳纤维密度高，果肉腐烂需要2-3年，腐烂后空腔占果核体积30%-40%。比如广东四会荔枝核，果肉腐烂后空腔明显，硬壳纤维厚度约0.5毫米，能长期保存。荔枝洞的形成跟品种有关，妃子笑和桂味腐烂后空腔更大，糯米糍硬壳更厚。所以荔枝洞的位置和材质都跟果肉腐烂过程直接相关，硬壳是果核保护机制，空腔是腐烂后的自然结果。