玛瑙染色就是用化学药水或植物染料把天然玛瑙染成其他颜色。染色后玛瑙表面会形成一层薄薄的染料膜，如果经常拿手摸或者接触硬物，染料容易蹭掉。掉色的玛瑙在阳光下看颜色不均匀，摸起来表面有黏腻感，而没掉色的玛瑙颜色均匀发亮。

玛瑙染色分两种，酸性染色用稀硫酸，植物染色用果胶。酸性染色玛瑙掉色快，因为药水腐蚀了玛瑙表面的保护层。有测试数据显示，用稀硫酸染色的玛瑙在3个月内掉色概率达90%，而正确保养的玛瑙能维持半年以上。植物染色玛瑙掉色慢，但遇汗液或雨水容易变色。比如某珠宝检测机构大前年报告说，染色玛瑙掉色主要和染料渗透深度有关，渗透浅的玛瑙掉色快，渗透深的掉色慢。如果经常拿手摸，染料容易蹭掉，特别是染了红色或蓝色的玛瑙，因为这类染料分子小容易迁移。染色的玛瑙在阳光下看颜色不均匀，没掉色的玛瑙颜色均匀发亮。