绿檀是黄色的因为木材里的鞣酸和酚类物质氧化了。新砍的绿檀是浅绿色，晒干后氧化变黄，放置越久颜色越深。就像苹果切开氧化变黑一样，绿檀接触空气时间越长，颜色越黄。

绿檀变色的原理是木材里的天然成分氧化反应。鞣酸含量高的绿檀氧化速度更快，比如广西产绿檀鞣酸含量达5.2%，存放一年颜色变深，五年可能变成深褐色。酚类物质在湿度超过70%时氧化加速，比如实验显示湿度80%环境下，三个月氧化程度比干燥环境高3倍。木材密度也会影响，密度0.85g/cm³的绿檀氧化比密度0.75g/cm³的快20%。氧化还会产生醌类化合物，让颜色从浅黄变深褐，就像铁生锈会变红褐色的道理一样。