黑珍珠不完全是黑色，它们的颜色介于深棕和深蓝之间。这种颜色成因和光线有关，在强光下会显得更接近黑色，暗处则偏蓝或带灰调。市场上说的“黑珍珠”其实是种统称，具体颜色由珠母贝分泌的珍珠质成分决定。

黑珍珠的颜色成因和珠母贝的生理特性有关。珍珠质的主要成分是碳酸钙，不同海域的珠母贝（比如大溪地黑蝶贝、墨西哥黑贝）分泌的碳酸钙结晶结构不同，导致颜色差异。国际珠宝协会数据显示，黑珍珠的色域覆盖Pantone 18-3852（深棕灰）到Pantone 19-4052（深蓝灰），其中超过60%的天然黑珍珠在自然光线下呈现接近黑色的视觉效果。珠母贝在分泌珍珠质时，如果体内含有微量铁元素，会氧化形成深色氧化物，这是黑珍珠偏灰调的原因。光线角度也会影响感知，比如45度侧光下，深蓝调黑珍珠会显得更黑，而正午直射光下深棕调的则更接近纯黑。但严格来说，黑珍珠的色度值（Hue Value）都在18-40之间，属于深色系但并非纯黑。