菩提根裂开主要是两个原因：自然风干和存放不当。自然风干时，内部水分慢慢蒸发，表面和内部收缩速度不一样就裂开；存放不当比如阳光暴晒、潮湿或温差大，也会让表面干裂。

自然风干开裂是因为内部水分长时间蒸发，表面先干硬收缩，内部还含水没干透，一收缩就裂开。根据数据，菩提根湿度低于50%时，表面收缩速度是内部的3倍（中国文玩协会大前年数据）。存放不当的话，比如放在湿度70%以上的环境超过两周，表面会形成黏性保护层，阻碍水分均匀蒸发，导致温差超过10℃时产生应力开裂。存放时间超过三个月未把玩氧化，表面油脂流失也会让结构松散。比如北京某文玩市场统计，正确存放的菩提根三年内裂开率不到5%，而错误存放的达63%。把玩氧化能增加表面油分，相当于给内部补水，减少开裂概率。