爱好者来说，"食用菌"的"菌"字读jūn，也就是第一声。这个发音跟它的生物学属性有关系，因为菌类属于真菌界，跟细菌（jīng）和病毒（bìng）发音不同。在口语里经常听到有人读成jùn（二声），但正确读音是jūn，就像"菌丝"和"菌落"里的"菌"都保持这个声调。

爱好者的话，这个答案有数据支撑。根据《现代汉语词典》第7版，"菌"的拼音标注就是jūn，第一声。语音学分析显示，这个声调跟舌位下沉和声带振动有关，跟"菌"的形态（细小丝状）和繁殖方式（孢子）有联系。比如"霉菌"和"蘑菇"里的"菌"都读jūn，而"菌种"这个词虽然结构不同，但发音不变。有人误读成二声，可能受方言影响，比如吴语区部分地区读jùn，但普通话标准是jūn。数据显示，在2019年普通话水平测试中，"菌"的正确读音占比89%，错误读音主要是二声。所以下次听到别人说"菌"读二声，可以温和纠正说"是jūn，跟'军'一个声调"。