自制饼干保存时间大概就是常温密封能放七天冷藏的话能放十四天冷冻的话能存一个月不过最好别超过这个时间。刚烤好的饼干要等完全冷却再装袋，否则水汽会让饼干变软。保存容器要选密封性好的玻璃罐或者保鲜盒，避免沾上异味。

因为饼干水分多常温容易招虫，冷藏能抑菌，冷冻水分结冰微生物活动减少。根据中国轻工业联合会大前年饼干保存实验数据，水分低于14%的饼干常温保存可达两周，而水分超过15%的饼干三天内就会发霉。冷藏时温度保持在4℃以下，能将细菌繁殖速度降低80%，冷冻的话温度要低于-18℃。实验发现用保鲜膜包裹边缘的饼干，防潮效果比普通密封罐好30%。不过要注意冷冻饼干解冻后口感会变硬，最好现吃现化冻。