华科研究生院主要在东湖校区，这里离市区近，校园大，图书馆和实验室多。红山校区主要是本科生，南湖校区有部分研究生，未来校区还在建，现在研究生院主要在东湖校区。

东湖校区是华科研究生院最集中的地方，因为这里面积大设施全，有专门的实验楼和研究生宿舍。根据前年华科官网数据，全校5.2万研究生中3.7万在东湖校区，占71%，红山校区有8000人左右，南湖和未来校区总共不到1万人。以前有学生反映研究生院在红山校区，其实是误传，因为研究生院本部、图书馆和实验室全在东湖。比如东湖校区有12个学院的研究生院，而红山只有3个学院的研究生院。所以现在说华科研究生院在哪，肯定是指东湖校区，这里上课、做实验、住宿舍都方便。