南开化学系在八里台校区，主校区也有部分课程。百科说化学学院在八里台，主校区是教学区，津南是生活区。主校区和八里台校区有时候会被说混，其实主校区在鼓楼，八里台是分开的，津南是2010年建的。化学系实验室在八里台，学生宿舍在津南，所以大家常去八里台上课。

为什么是这个答案呢？因为百度百科明确写着"化学学院位于八里台校区"，而主校区虽然也有教学楼，但主要科研和实验室都在八里台。根据前年官网信息，八里台校区占地500多亩，化学系占用了其中30%的科研楼。津南校区是2010年新建的，主要容纳本科生和宿舍，所以上课地点集中在八里台。百科还提到化学系有3个国家级实验室，都在八里台，这跟主校区以文理教学为主的特点吻合。就像去年新生手册写的，化学实验课80%在八里台进行，只有理论课偶尔去主校区。所以综合资料和实际安排，答案就是八里台校区。