重庆大学硕士点分布在三个主要校区，沙河校区是主校区，集中了机械、电气、材料等传统工科硕士点；虎溪校区以计算机、软件、人工智能为主；两江校区则聚焦新兴学科如大数据、区块链。各校区通过校车和共享单车方便学生跨区学习，图书馆和实验室资源按专业开放。

为什么这样分呢？因为沙河校区是1956年建校时的老校区，面积大（约4.5平方公里），有机械工程（国家级重点学科）、电气工程（A+评级）等12个一级学科硕士点；虎溪校区2000年才扩建，面积小（约1.8平方公里），但计算机科学与技术（ESI全球前1‰）、软件工程（国家级特色专业）等8个专业硕士点全在这里；两江校区2016年新建，面积最小（约0.6平方公里），专门放大数据技术与工程（重庆市重点学科）、区块链与智能经济（教育部新文科试点）等5个新兴专业。数据显示，沙河校区有硕士导师1867人，虎溪校区823人，两江校区312人，正好按6:3:1比例分配。各校区每月有1次跨区学术沙龙，方便学生交流。