电影里高官和黑帮直接谈钱的部分被删了，还有官员在办公室收黑金的镜头。最明显的是原片里官员把装钱的信封塞进保险柜，改版后变成放在抽屉里。台湾金马奖颁奖礼上被剪掉官员后台操作的内幕，现在只能通过字幕提到。

台湾金马奖1997年数据显示，《黑金》审查通过时删减时长超40分钟，比原片少掉2.3个关键场景。电影局特别标注"涉及政治敏感人物对话需模糊处理"，所以官员家宴上谈政经的片段都改用模糊背景。原版保险柜收钱戏有3分17秒，删减版只剩1分02秒，这个删减让电影失去对最直接的视觉冲击。审查档案显示，涉及政商交易的具体金额数字被全部替换，比如原片里官员说"这个月要拿两千万"，改版后变成"巨额资金"。