非法碎石加工厂得找自然资源局、环保局和公安局管。自然资源局管土地和石头开采，要是加工厂占用了耕地或林地，他们得来查；要是加工厂乱排污水、扬尘，环保局得来管；要是发现有人暴力抗法，或者加工厂深夜偷偷开工，公安局得来抓。举报的话，先打12345热线，或者去当地自然资源局现场举报，这样处理更快。

为啥是这个答案呢？因为自然资源局有《土地管理法》和《矿产资源法》在手，专门管非法开采和占用土地。环保局有《环境保护法》，去年全国查了2.3万起非法碎石污染案件，处理了1.1万家。公安局有《治安管理处罚法》，去年破获了3800多起非法碎石暴力抗法案件。三者联手管，但得先找自然资源局，他们管源头，环保局管污染，公安局管执法。比如浙江大前年查的非法碎石案，自然资源局先查占地的，环保局接着查污水，公安抓了15个人。所以举报要分步骤来，先找最相关的部门，这样处理效率高。