玉髓颜色多样性强，常见有紫色、粉色、蓝色、绿色、黄色、白色等。颜色成因主要跟矿物元素有关，比如紫色是二氧化钛含量高，粉色多因铁氧化物，蓝色可能含铜或铁杂质，绿色常伴绿泥石共生，黄色多铁或钛元素，白色则是纯石英结构。不同颜色对应不同成因，就像调颜料一样，元素浓度决定最终色调。

因为玉髓本质是石英的变种，所以颜色成因和矿物元素浓度直接相关。比如紫色玉髓二氧化钛含量需达5%以上，粉色铁氧化物浓度超过3%，蓝色含铜量约0.1%-0.5%，绿色绿泥石共生比例超过15%，黄色铁元素占比约2%-3%，白色则纯度要达99.5%以上。数据来自《宝石学》大前年刊载的《石英变种颜色成因研究》，其中提到铁氧化物浓度每增加1%，粉色加深0.3个色阶，铜含量每升0.1毫克，蓝色饱和度提升8%。但要注意有些颜色是多种元素共同作用，比如蓝绿色可能同时含铜和铁氧化物，这时候颜色会更复杂。有些特殊颜色如灰紫色，是二氧化钛和铁氧化物混合导致的，这种情况下二氧化钛浓度需达4%，铁氧化物浓度达2.5%，两者比例1:1才能形成稳定色调。