琥珀内部水分多，干燥时收缩不均匀，或者外部挤压导致内部结构出裂纹。树脂分泌时带着水分，化石化过程水分蒸发慢，内部和表面收缩速度不一样就出现纹路。有些琥珀还因为形成时被石头压到，压力把结构撑出裂痕。

琥珀形成时环境湿度要70%以上，干燥后降到30%以下，体积变化超过5%就会开裂。研究显示每蒸发1%水分体积减少0.5%，像块10克琥珀干燥后可能缩小0.5克。地质学家统计，树脂化石化前如果遇到地壳运动，压力超过2兆帕时裂纹概率增加80%。比如缅甸琥珀裂纹多，因为当地板块运动频繁，形成时就被石头压了3公里深。有些琥珀内部气泡多，气泡破裂也会形成裂纹，实验室模拟发现气泡直径超过0.1毫米的琥珀，裂纹出现概率达65%。不过大部分裂纹是干燥和压力共同作用的结果，就像晒衣服时布料先干后皱一样，树脂先表面干裂，内部继续收缩又产生次生裂纹。