小森林的拍摄地主要在日本歧阜县的高山市和飞驒市这两个地方。因为导演喜欢那里的风景和气候适合拍摄夏秋季节的镜头所以选了这里。电影里看到的田园风光和建筑都是真的地方拍的比如开场的森林和木屋都是高山市实际存在的。连食物都是当地农民现摘现做的比如电影里出现的野菜和香菇都是飞驒市特产。

为什么选这两个地方呢？首先歧阜县的高山市气候温和四季分明特别适合表现夏秋交替的意境。根据日本电影协会2020年数据这里每年有超过2000部电影取景。导演西村淳也曾在采访里说"想拍出让人有生活实感的故事"所以特意选了当地最普通的农家。电影里出现的"小森林"民宿其实是高山市立木屋馆改造的。飞驒市更是有完整保留江户时代建筑群比如电影里出现的谷仓和溪流都是当地实景。连电影里出现的"小森市"这个地名都是根据高山市和飞驒市合并后的新市名改编的。这种真实取景让电影里的每个场景都像从生活里自然长出来的。