山本总队长死在尸魂界篇里，他偷拿总队长令牌想当新总队长，结果被流魂街干部围攻打不过就挂了。这事儿在第428话到429话有讲明白。

他夺取令牌是为了证明自己比总队长强，结果刚出灵王宫就被干部们堵在尸魂界入口。黑崎一护、朽木白哉、乌尔奇奥拉这些干部一个一个上，他连挡五招就喘不过气了。白哉的斩魄刀直接砍他腰上，乌尔奇奥拉的鬼道术烧得他满身焦黑。最惨的是被一护用十步一杀砍断右臂，血都喷出来了。根据漫画数据，这场战斗他连换三套衣服，被流魂街集体围殴致死。其实他早该知道总队长令牌不能随便抢，尸魂界规矩比他想象的严多了。