丑桔没种子主要是人工选育的品种特性，跟普通柑橘不同。种植户为了减少处理麻烦，专门培育了无籽的丑桔，这样吃的时候不用吐籽。有些丑桔表面有凸起，那是残留的果蒂或者虫眼，跟种子没关系。因为丑桔是人工选育的无籽品种，所以通常没有种子，但个别可能因为变异长出小凸起。

丑桔没籽是农业部门重点推广的无籽品种，农业农村部大前年数据显示国内丑桔无籽率超80%。这种特性源于染色体变异或激素处理，比如用赤霉酸处理果蒂，抑制种子发育。普通柑橘种子凸起是因为胚珠发育成种子，但丑桔经过选育后胚珠退化，所以表面平滑。不过有些果园为保留风味，会保留少量籽，导致个别果实出现凸起。比如重庆奉节产区统计，95%丑桔完全无籽，剩下5%有0-3粒籽，凸起部位多在果蒂附近。这种差异跟品种纯度、授粉情况有关，但整体还是无籽为主。