嫌疑人X不直接抛尸，而是把尸体藏在自家玄关，烧掉指纹主要是为了保护靖子不被怀疑。他利用数学家的专业知识，计算出抛尸最佳时机在凌晨三点，这时邻居不会注意到异常响动。烧指纹是为了彻底消除尸体存在的证据，因为指纹在特定环境下能存活48小时，直接丢弃可能被警方通过监控或现场残留物追踪到。书中提到汤川学用概率模型推算出抛尸后邻居听到动静的概率是0.7%，烧指纹后指纹存活时间缩短到12小时内，这样即使被调取监控，也找不到直接证据指向靖子。

烧指纹这个操作其实有双重作用。汤川学提前烧掉自己的指纹，防止警方通过玄关监控发现异常，因为监控录像里他本该在书房解题。烧指纹能制造出尸体在案发后两小时就被处理的假象，而实际尸体在玄关藏匿了整整20小时。根据日本警方数据，指纹在干燥环境下平均存活时间约24-48小时，但高温燃烧可将存活时间压缩到2小时内。书中还提到汤川学用拓扑学原理计算出尸体在玄关移动时的声音分贝值，控制在55分贝以下（相当于正常谈话声），这样邻居即使听到动静也不会怀疑有尸体。烧指纹后，警方调取玄关监控时，只能看到汤川学在凌晨两点离开书房，但无法证明他何时返回处理尸体，从而形成完美不在场证明。